臨床医学オントロジー CONAND
(Clinical Ontology in Anatomaical Structure and Disease)
医療情報システムのための医療知識基盤データベース研究開発事業
成果公開サイト (2007・2008-9, 2010-2012, 2013-2015年度)
Contents:
- 事業概要
- 疾患オントロジー
- 解剖オントロジー
- 異常状態オントロジー
- ツールダウンロード
- 利用契約締結に係る連絡先
- 本ページの資料は概要を把握するためにPDFまたはTXT形式データで公表するものです。転載、再利用、引用等は現時点ではご遠慮ください。
- オントロジーの原本データベースファイル（XML形式等）の利用を希望される方は、利用契約を締結した後に提供しますので、本サイト末尾の連絡先までご連絡ください。なお、現時点では研究、評価等の非営利目的での利用に限定しています。
事業概要
疾患オントロジー
- 疾患オントロジー事例集
- 疾患オントロジーで表現されている疾患の異常状態連鎖をViewerで表示した例
(7診療科領域の代表例10例ずつ) を示したものです。
- 全記述内容は下記のViewerからご覧頂くことが可能です。
- 疾患オントロジーナビゲータ "Disease Compass"
- 疾患オントロジーLinked Data（RDF）版のSPARQLエンドポイント
- 疾患オントロジーViewer
- このビューワーは利用申込みが個別に必要です。末尾の連絡先にメールください。
- 本 Viewer は GraphOn 社の Go-Global というミドルウェアを利用し、
サーバー側のブラウザを通じて閲覧する仕組みです。利用のためにはご使用のOSに合わせた
Go-Globalクライアントソフトウエアのインストールが必要となりますのでご了承下さい。
- 利用手順は以下のようになります (現時点では Windows からの利用のみとさせて頂きます)
- WindowsのIEから上記のViewerリンクを開いて下さい
- プラグインのインストールを促す画面が表示されたら許可してインストールして下さい
- 再度アクセスすると、ログインするための "Sign-in" という画面が現れますので、
- Username: demo
- Password: demo
にてログインして下さい
- サーバーにて起動可能なプログラムが表示されます。"iexplorer" をダブルクリックして起動して下さい
- ビューアの使い方の説明ページが表示されますので十分にお読みの上、「使ってみる」あるいは「疾患オントロジービューア」のリンクを押して起動して下さい。
- 内部限定ページ
解剖オントロジー
- 解剖オントロジー概要
- 脳・感覚器・生殖器・皮膚を除く人体解剖学の知識を記述しています。ここでは全体の概要と法造形式の記述例、並びに表現されている接続関係の事例を示しています。
- RDB スキーマ
- 法造形式の解剖オントロジーを自動変換した関係データベース(RDB) のスキーマを示したものです。
- ダウンロード
- 法造形式の解剖オントロジーを自動変換した関係データベース(RDB、SQLite) です。
- 検索・閲覧
異常状態オントロジー
- オントロジーを利用するための各種ツールを提供しています。現時点では利用契約を締結した後に提供しますので、下記連絡先までご連絡ください。
利用契約締結に係る連絡先
- オントロジーの原本データベースファイル（XML形式等）の利用を希望される方は、利用契約を締結した後に提供しますので、下記連絡先までご連絡ください。なお、現時点では研究、評価等の非営利目的での利用に限定しています。
- 東京大学 大学院医学系研究科 医療情報学分野 大江和彦研究室
- Email: ohe-office [at] hcc.h.u-tokyo.ac.jp
開発メンバー (作業中)
※所属は当時のものです
copyright (c) 2016 東京大学 大学院医学系研究科 医療情報学分野